Werf
Dok pertama adalah Werf.
Werf berasal dari Bahasa Belanda yang bermakna galangan.
Seperti maknanya, Werf merupakan tempat galangan kapal di kompleks Pelabuhan Jayapura.
Galangan kapal ini diberi nama Destroyer Repair Base karena fungsinya untuk melakukan perbaikan ringan pada kapal perusak atau torpedo.
Toponim Werf masih digunakan saat ini dengan pelafalan Weref.
Lokasi juga masih sama di kompleks Pelabuhan Jayapura.
Di wilayah ini dibangun Den Jasa Ang Bekangdam XVII/Cenderawasih, serta pula pemukiman warga.
Dok 2
Dok 2 dibangun dengan tiga jalur, yakni atas, tengah, dan bawah.
Di Dok 2 Atas dibangun Centraal Ziekenhuis (Rumah Sakit Umum Pusat), Kantor De Dienst van de Malariabestrijding (Kantor Pemberantasan Malaria), dan Hogere Mantri Verplegingschool (SMA Keperawatan).
Adapun Centraal Ziekenhuis merupakan cikal bakal dari RSUD Jayapura yang ada saat ini.
Sedangkan Hogere Mantri Verplegingschool merupakan cikal bakal dari SMK Kesehatan yang ada saat ini.
Kemudian, Dok 2 Tengah “Bovenweg” dibangun jalan yang berbelok-belok, dengan sedikit tanjakan dan turunan, menuju Julianaweg (sekarang Jalan Trikora) di Dok 5 Atas, melewati perumahan di van Heutz Camp (sekarang Bhayangkara).